發(fā)酵床分解糞尿的能力主要取決于發(fā)酵床菌種的活力，菌種活力越強新陳代謝就越旺盛。要保障發(fā)酵床菌種旺盛的新陳代謝能力，提高分解糞尿的效果，就是要保障菌種的生存環(huán)境。多年實踐證明，影響發(fā)酵床養(yǎng)豬糞便分解的因素有以下幾個方面：
（1）菌種活性
發(fā)酵床發(fā)酵分解糞尿的過程是微生物新陳代謝的結果。所以，發(fā)酵床菌種活力的高低決定了糞便分解和墊料發(fā)酵的效率，是發(fā)酵床制作的首要關鍵因素，因此制作發(fā)酵床一定要選擇活力強大的菌種。推薦使用發(fā)酵床菌種行業(yè)老品牌“農富康發(fā)酵床菌種”。
（2）墊料原料
菌種不斷繁殖所需要的最佳碳氮比是25：1。豬糞尿的碳氮比是7：1，主要提供氮元素，而且是持續(xù)產生的。墊料原料主要提供碳元素，所以其碳氮比越高，功能菌合成新細胞的速度也就越快、數量越多，墊料的使用效果也就越好，使用年限也就越長。
（3）透氣性
發(fā)酵床中的功能菌多是耗氧性微生物，氧氣的供給是耗氧性微生物增長繁殖不可缺少的，因此在平時的發(fā)酵床管理中要多注意墊料的透氣性，做到及時翻倒。
（4）水分
水分是影響微生物生命活動的重要因素，微生物在發(fā)酵床墊料里進行著生命活動。同時，水分也影響墊料內部的養(yǎng)分和微生物的移動，影響發(fā)酵效率的高低，也影響空氣成分和墊料及豬舍內的溫度。
（5）厚度
參與發(fā)酵的微生物，通常在30℃以上的環(huán)境溫度下，增殖變旺盛。所以，發(fā)酵床的厚度是決定溫度的重要因素，發(fā)酵床養(yǎng)豬一般要求墊料厚度為50cm以上，占地不得小于20平米。
結合實際使用情況來講，影響的因素有：菌種的選擇、墊料的選擇、當地的圈舍結構、地下水位、圈舍的單位飼養(yǎng)密度和發(fā)酵床的維護情況。經用戶反應：只要發(fā)酵床維護得當，可以持續(xù)使用3～5年。發(fā)酵床養(yǎng)殖，省工省料，制作簡單，后期維護方便等諸多優(yōu)點已被廣大養(yǎng)殖戶所青睞。

（6）養(yǎng)殖密度

 不同的菌種活性不同，分解糞尿的速度也不同，所以，單位面積內的糞便過多，可能超出菌的分解能力，不能在有限的時間內及時分解掉糞便；所以，應保持合理的養(yǎng)殖密度，確保糞便及時快速分解。